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二代测序对于肿瘤的意义

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118342 222 newlifepku 发表于 2015-4-10 23:34:52 |
newlifepku  初中一年级 发表于 2015-4-13 23:43:44 | 显示全部楼层 来自: 北京
桂圆 发表于 2015-4-13 21:05
如果在异地,是通过邮寄外周血的方式吗?

可以的,华大在各个地方都有销售和医院事务,可让他们帮抽血、邮寄,报告等也可联系他们,具体的站内联系。
newlifepku  初中一年级 发表于 2015-4-13 23:48:54 | 显示全部楼层 来自: 北京
wangzhe_xm 发表于 2015-4-13 23:08
从互联网获得的信息是:
备受瞩目的高通量测序技术临床应用试点单位第一批名单公近日,备受瞩目的高通量测 ...

http://www.chemdrug.com/news/232/9/41989.html

刚刚批复的,才几天吧。华大在广州、天津、武汉等多个区域具有试点资质
newlifepku  初中一年级 发表于 2015-4-14 00:06:24 | 显示全部楼层 来自: 北京
wangzhe_xm 发表于 2015-4-13 23:38
能否请“ newlifepku ”贴几个华大基因的检测案例供大家参考。比如非小细胞肺癌耐药后检测的结果。最好有详 ...

案例1:

临床背景:女,48岁,非小细胞肺癌,左肺腺癌并左肺门及纵隔淋巴结转移
常规检测:检测EGFR和KRAS的热点突变,发现EGFR存在L858R突变(NM_005228),KRAS基因2号外显子12,13号密码子无变异。预示对EGFR的抑制剂易瑞沙(也称吉非替尼)敏感。
临床方案:给药易瑞沙口服2个月,病灶无明显变化,提示可能药物无疗效。
Oseq-T检测:对该患者原发癌组织及淋巴转移癌组织样本进行Oseq-T测序,发现患者除存在EGFR的L858R药物敏感突变,ERBB2(Her2)亦存在Ala733Val激酶区突变(PMID:16397024) 。据研究报道,ERBB激酶区突变会导致患者对可逆的EGFR-TKIs如特罗凯(也称厄罗替尼)、易瑞沙等耐药。但是对不可逆的EGFR-TKIs,如Afatinib敏感(2013年FDA批准的一线治疗药物)。
总结:解释了患者服用易瑞沙无效原因,并为临床新方案制定提供参考。
临床意义:
A. 避免盲目用药,耽误治疗,造成经济负担;
B. 给患者更多的选择,找到最佳治疗方案;


案例2:
临床背景:
女性,51岁,2003年诊断为乳腺浸润性导管腺癌,ER和PR阳性,进行了保乳根治性手术,并一直在接受激素治疗。2014年7月份发现癌症复发,并出现骨转移。
由于无法手术再获取肿瘤组织进行药物基因检测,患者抽取5 mL外周血送到华大医学,进行了Oseq™-ctDNA无创肿瘤个体化诊疗基因检测。
Oseq™-ctDNA检测结果:PIK3CA H1047R,该突变使得PIK3CA持续活化,从而导致其下游mTOR通路被激活,造成肿瘤病情发展。
治疗方案:基于Oseq-ctDNA检测结果,患者使用了mTOR抑制剂。mTOR抑制剂能抑制mTOR通路过度活化,FDA批准用于进展期乳腺癌。: 
治疗结果:在服用mTOR抑制剂三个月后,患者的骨转移得到缓解,没有出现新的转移灶。对于这个患者,华大医学在进行进一步的跟进和服务。


先放这两个案例吧,华大基因作为全球最领先的基因测序公司,在外周血检测肿瘤基因突变,进行精准医疗方面是国内首屈一指的,这个也是真正能帮助到患者的一项产品。
WWW  初中一年级 发表于 2015-4-14 00:25:11 | 显示全部楼层 来自: 英国
能测PD-L1之类的吗?
zzz2008yyy  小学四年级 发表于 2015-4-14 07:25:19 | 显示全部楼层 来自: 北京
楼主能发一些资料看一下吗?
brookzhan  高中三年级 发表于 2015-4-14 16:20:05 | 显示全部楼层 来自: 美国
价格略贵,如果价格只有3000元就好了。
brookzhan  高中三年级 发表于 2015-4-14 16:22:46 | 显示全部楼层 来自: 美国
外周血液里是不是癌细胞可能会不够呢?这样检测的结果会不会不准?
我询问主治医生,她说由于胸水和血液里的癌细胞可能不够,会导致检测的假阴性。
newlifepku  初中一年级 发表于 2015-4-14 16:38:12 | 显示全部楼层 来自: 北京
brookzhan 发表于 2015-4-14 16:22
外周血液里是不是癌细胞可能会不够呢?这样检测的结果会不会不准?
我询问主治医生,她说由于胸水和血液里 ...

这与是什么癌症类型有关,肺癌、胰腺癌这些恶性程度比较高的癌种,尤其是到了中晚期,血液里有很多循环肿瘤细胞的。而且外周血里检测的不是循环肿瘤细胞,而是来自肿瘤细胞的DNA,因为肿瘤在转移时会释放到血液里很多肿瘤细胞,这叫循环肿瘤细胞,但是这些循环肿瘤细胞绝大多数是转移不成功的,不然人体就到处都是了,因为有统计,晚期患者有成千上万个循环肿瘤细胞,几乎都在外周血里裂解了,里面的DNA释放到外周血里。就可以检测到了,另外固定不动的肿瘤细胞也会不断凋亡,所以晚期患者体内有很多的肿瘤DNA的,这么说吧,如果一个肿瘤导致人生命危险的根本原因在于转移,外周血的肿瘤细胞是转移的基础,如果检查不到那么就说明没有转移和复发,也是值得高兴的事情。最后我们测序,会给出数据的,如一个突变,检测到的频率多高。
胸水里,也有肿瘤细胞,我们也可以将胸水离心,取下层的细胞,去检测。目前一些医生已经在开始这方面的应用了。
newlifepku  初中一年级 发表于 2015-4-14 16:46:39 | 显示全部楼层 来自: 上海
本帖最后由 newlifepku 于 2015-4-15 13:14 编辑
WWW 发表于 2015-4-14 00:25
能测PD-L1之类的吗?


抱歉,我查阅了下那基因列表,暂时不包含这个基因,我给研发的同事反映下,后续升级产品时,给予加上。而且PD-L1基因是检测表达量,这个是用组织检测,而且目前高通量测序在检测基因的表达量上,最多是通过计数reads数,不是很准确的,应该是用QPCR等方式。
newlifepku  初中一年级 发表于 2015-4-14 16:52:40 | 显示全部楼层 来自: 上海
brookzhan 发表于 2015-4-14 16:20
价格略贵,如果价格只有3000元就好了。

有一些产品较为便宜,是检测患者对化疗药物的耐受性的(2000-3000左右)。这个以外周血的检测的产品,由于检测的基因数目较多,确实成本较高。后续价格等降低后,一定第一时间与大家沟通、反馈

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